Công ty A thực hiện hợp đồng gia công số 01 ngày 01/06/2017. Hợp đồng có thời hạn hiệu lực trong vòng một năm. Ngày 10/06/2018, công ty A nộp bản thông báo về việc xử lí nguyên phụ liệu dư thừa sau khi hợp đồng gia công 01 trên kết thúc. Trong bản thông báo này công ty A có xin chuyển toàn bộ số nguyên liệu dư thừa của hợp đồng gia công số 01 là 10.000 mét vải sang hợp đồng gia công số 02 (Cùng đối tác đặt gia công). Ngày 05/07/2018, công ty A mới đăng kí tờ khai chuyển tiếp 10.000 mét vải trên. Theo anh/chị trong trường hợp này chi cục hải quan gia công sẽ xử lí như thế nào?