Công ty A nhập khẩu 10 tờ khai theo loại hình nhập nguyên liệu để sản xuất hàng xuất khẩu tại Chi cục HQ Gia Công - Cục HQ TPHCM, mặt hàng "vải các loại", số lượng 210.000 yards. Sau một năm kể từ ngày nhập khẩu tờ khai cuối cùng, công ty A chưa đăng ký tờ khai xuất sản phẩm sản xuất xuất khẩu. Đồng thời có nguồn tin cho thấy Công ty A có bán ra thị trường nội địa một số lượng lớn "vải các loại". Tra cứu trên hệ thống quản lý rủi ro, Công ty A không nhập khẩu loại hình nào khác. Trường hợp này cơ quan HQ quản lý Công ty A phải làm như thế nào?