Chi cục hải quan Gia công TPHCM kiểm tra cơ sở sản xuất của công ty A, công ty thông báo cơ sở sản xuất với ngành nghề may mặc với năng lực sản xuất 100.000 sản phẩm một năm. Chi cục Hải quan Gia công thực hiện kiểm tra cơ sở sản xuất công ty A thì phát hiện công ty A có nhà xưởng nhưng không có máy móc phục vụ ngành may mặc. Trường hợp này cơ quan Hải quan xử lý thế nào?